Vía barrapunto encuentro esta comparativa de frameworks de Ajax que han realizado los chicos de ajaxpatterns. Yo suelo usar siempre prototype ya que me resulta fácil de implementar y ya estoy acostumbrado a este framework pero bueno siempre va bien conocer nuevas librerias para implementar Web 2.0.
Documentación excelente sobre la libreria prototype- >> Using prototype
Os dejo el link para más info comparativa frameworks